是雙一流大學。雙一流大學一般指世界一流大學和一流學科。上海中醫(yī)藥大學是世界一流學科建設高校，一流學科：中醫(yī)學、中藥學。

上海市“重中之重”學科（1個）：中藥學

上海市重點學科（9個）：中醫(yī)婦科學、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)系統(tǒng)實驗方劑學、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中藥學、針灸推拿學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)外科學、中醫(yī)內科學

上海高校一流學科（6個）：A類-中藥學；B類-中醫(yī)學、中西醫(yī)結合、科學技術史；培育-護理學、藥學

上海高校高峰高原學科（4個）：I類高峰-中藥學、I類高峰-中醫(yī)學、I類高峰-中西醫(yī)結合、I類高原-科學技術史

上海市教育委員會重點學科（5個）：中藥臨床藥理學、中藥藥劑學、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)脾胃病學、中西醫(yī)結合基礎